Üblicherweise wird durch Tests sichergestellt, dass das Immunsystem nicht auf körpereigene Proteine und Zellen (Selbstantigene) reagiert. Bei einem fehlgesteuerten Immunsystem ist bei manchen Patienten die Toleranz gegenüber einigen Selbstantigenen gestört und die autoreaktiven T- und B-Zellen greifen irrtümlicherweise das körpereigene Gewebe an.
Die Multiple Sklerose ist eine solche Autoimmunerkrankung.